Pomimo rozwoju nauki i badań, w dalszym ciągu problematyczna dla lekarzy i naukowców pozostaje kwestia składu flory jelitowej. Optymistyczne jest to, że z roku na rok nasza wiedza oraz świadomość dotycząca właściwego dbania o układ pokarmowy, rośnie. Właściwa dieta, unikanie mocno przetworzonej żywności, czy rozsądne korzystanie z używek sprawiają, że flora bakteryjna jelit nie jest narażona na zmiany, czy też niekorzystne przerosty.